Οι συντηρητές συνεργάζονται στενά με επιμελητές και επιστήμονες άλλων οργανισμών συχνά δε εργάζονται ανά ομάδες, αλληλεπίδραση που προάγει σημαντικά τις γνώσεις μας σχετικά με τα υλικά και τις τεχνικές κατασκευής των έργων.
Η προετοιμασία εκθέσεων απαιτεί το συνδυασμό πολλών διαφορετικών και εξειδικευμένων εργασιών και τη συνεργασία των συντηρητών με τους σχεδιαστές, τα μέλη του τμήματος τεχνικής υποστήριξης του μουσείου και τους μεταφορείς έργων τέχνης. Το ειδικό πλαίσιο γνώσεων των συντηρητών εξασφαλίζει ότι ο χειρισμός όλων των έργων κατά τη διάρκεια της μεταφοράς, της ανάρτησης και της έκθεσης είναι ο απόλυτα ενδεδειγμένος.
Το τμήμα αποτελείται από έξι διαφορετικά εργαστήρια εξειδικευμένα στον περιβαλλοντικό έλεγχο, τη μελέτη και τη συντήρηση ζωγραφικής, μετάλλου, γυαλιού και οργανικού υλικού, χαρτώου υλικού, κεραμεικού, υφάσματος και φωτογραφίας, τα οποία υποστηρίζονται από το εργαστήριο έρευνας. Για την αντιμετώπιση σύνθετων, ως προς τα υλικά τους αντικειμένων, απαιτείται η συνεργασία συντηρητών διαφορετικών ειδικοτήτων.
Το τμήμα εισηγείται σχετικά με ζητήματα προληπτικής συντήρησης, μουσειακού περιβάλλοντος, αποθήκευσης, ελέγχου βιολογικών παραγόντων, νέων αποκτημάτων καθώς και της ασφαλούς μεταφοράς των έργων. Τα μέλη του συνοδεύουν επίσης τα αντικείμενα που ταξιδεύουν να εκτεθούν στην Ελλάδα και το εξωτερικό ή αποτελούν αντικείμενα δανεισμού.
Στο πλαίσιο του εκπαιδευτικού του ρόλου το τμήμα παρέχει θέσεις μαθητείας σε σπουδαστές συντήρησης και συναφών με τον κλάδο ειδικοτήτων από όλο τον κόσμο. Με τον τρόπο αυτό καθώς επίσης και με την ενεργή συμμετοχή μελών του σε εθνικά και διεθνή ερευνητικά προγράμματα καλλιεργείται η συνεργασία με άλλα ιδρύματα και η συστηματική, πολλαπλά επωφελής, ανταλλαγή γνώσεων στον τομέα της συντήρησης.
Εργασίες και προγράμματα συντήρησης αλλά και ερευνητικά αποτελέσματα που προκύπτουν από μελέτες της ομάδας, δημοσιεύονται σε ποικίλα διαθέσιμα μέσα, στο περιοδικό του μουσείου, σε καταλόγους εκθέσεων, ειδικές εκδόσεις του μουσείου, βιβλία, πρακτικά συνεδρίων και προβάλλονται συστηματικά μέσω του διαδικτύου.
Το τμήμα παρέχει επίσης συμβουλευτικές υπηρεσίες, αναλαμβάνει τη συντήρηση και αποκατάσταση έργων καθώς και το σχεδιασμό και την οργάνωση εκθέσεων για μουσεία, πολιτιστικούς οργανισμούς καθώς και για ιδιώτες.